甘肅工程咨詢集團有限公司于2018年4月組建成立，是省委省政府整合原廳局管理的各類工程咨詢型企業重組設立的產業集團，屬商業一類企業。入組的8戶子公司分別為：甘肅省建筑設計研究院有限公司、甘肅省水利水電勘測設計研究院有限責任公司、甘肅省城鄉規劃設計研究院有限公司、甘肅土木工程科學研究院有限公司、甘肅省招標咨詢集團有限責任公司、甘肅省交通工程建設監理有限公司、甘肅省建設監理有限責任公司、蘭州乾元交通規劃設計咨詢有限公司，均為工程咨詢領域的科技服務類企業。

2018年12月，國家證券監督管理委員會行政許可批復同意以甘肅省國有資產投資集團有限公司現金出資購買蘭州三毛實業股份有限公司發行股票的資產重組方案，甘肅工程咨詢集團資產整體置入深圳證券交易所上市公司蘭州三毛實業股份公司（證券簡稱：三毛派神），上市公司以甘肅工程咨詢集團有限公司子公司和蘭州三毛紡織（集團）有限責任公司子公司“雙主業”運營，甘肅工程咨詢集團初步完成上市運營目標。

2019年5月，上市公司蘭州三毛實業股份有限公司董事會、股東大會審議通過了向控股股東甘肅省國有資產投資集團有限公司轉讓上市公司毛紡業務子公司的相關議案。2019年5月底，雙方完成資產交割和過戶手續，毛紡業務子公司退出上市公司，上市公司主營業務變更為工程咨詢單主業運營。根據甘肅省市場監督管理局建議并經省政府國資委同意，作為上市公司的蘭州三毛實業股份有限公司更名為“甘肅工程咨詢集團股份有限公司”，甘肅工程咨詢集團有限公司更名為“甘肅省建設工程技術集團有限公司”。其中，甘肅省建設工程技術集團有限公司作為2018年上市公司重大資產重組向證監會承諾的三年（2018年至2020年）業績對賭主體存續。

2019年6月5日，深圳證券交易所事前確認上市公司名稱變更為“甘肅工程咨詢集團股份有限公司”和證券簡稱變更為“甘咨詢”的申請；7月1日，甘肅省市場監督管理局通過上市公司營業執照變更申請，核發新營業執照；7月3日公司名稱“甘肅工程咨詢集團股份有限公司”及證券簡稱“甘咨詢”正式在資本市場亮相（股票代碼000779）。上市后總股本由資產重組前的1.86億股增加至3.80億股。

2020年5月21日，甘肅工程咨詢集團股份有限公司召開第一次黨員代表大會，審議通過了宋忠慶同志代表集團黨委向大會作的題為《堅決落實兩個“一以貫之”  打造全國一流工程咨詢產業集團》的報告，選舉產生集團第一屆黨委會和紀律檢查委員會。大會提出，“十四五”時期，是集團追趕先進、全面轉型升級的重要時期，是全力打造全國一流工程咨詢產業集團的關鍵時期。要以習近平新時代中國特色社會主義思想為指導，把準高質量發展主旋律，深化改革、轉型升級；按照“黨建引領、資本引路、創新驅動、業務集成、綠色發展”二十字戰略方針為總攬，打造“規劃咨詢、勘察設計、監理檢測、工程總承包、資本運營”五大業務板塊，培育核心競爭優勢；以全面一流企業的嶄新面貌，奮力躋身全國同行業先進行列。

目前，甘肅工程咨詢集團股份有限公司已經發展成為甘肅省工程技術領域業務最全、資質最優、技術實力最強的產業集團。現有8個二級子公司，17個三級子公司，職工4500余人。截止2021年上半年，公司資產總額35.38億元，總負債13.13億元，凈資產22.25億元，資產負債率37.10%。能有效運營與保障以EPC模式為代表的工程總承包項目，在水利、建筑、交通等細分行業具有較強的技術服務能力。